Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 SSM4YIL030C 3960 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 LSO2YGR169C-A 279 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 COX23YHR116W 456 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 INA22YIR024C 651 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 ANB1YJR047C 474 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 YLR255CYLR255C 354 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 BNI4YNL233W 2679 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 DFG16YOR030W 1860 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 APL4YPR029C 2499 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 SPA2YLL021W 4401 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 COG3YER157W 2406 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 ALA1YOR335C 2877 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 CDC20YGL116W 1833 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 snR74snR74 88 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 TRX1YLR043C 312 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 MSH2YOL090W 2895 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 APC11YDL008W 498 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 CCM1YGR150C 2595 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 KAR3YPR141C 2190 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 RDS1YCR106W 2499 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 YPR022CYPR022C 3402 nt3.28□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 SEC15YGL233W 2733 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 YDR286CYDR286C 345 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 ULI1YFR026C 510 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 YGL024WYGL024W 336 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 YHR210CYHR210C 1026 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 FPR1YNL135C 345 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 VPS54YDR027C 2670 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 XRS2YDR369C 2565 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 MSR1YHR091C 1932 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 TRM2YKR056W 1920 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 YGL069CYGL069C 465 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 YLR012CYLR012C 300 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 TMA108YIL137C 2841 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 YLR352WYLR352W 2424 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 YOL057WYOL057W 2136 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 YDR193WYDR193W 399 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 YHR217CYHR217C 462 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 SGF11YPL047W 300 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 TIM12YBR091C 330 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 MTR4YJL050W 3222 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 DOT6YER088C 2013 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 TOP1YOL006C 2310 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 RNR1YER070W 2667 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 FLO10YKR102W 3510 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 MUK1YPL070W 1839 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 RPS8AYBL072C 603 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 SPT21YMR179W 2277 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 TMN3YER113C 2121 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 GIN4YDR507C 3429 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 YEL073CYEL073C 324 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 SPT4YGR063C 309 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 RAM2YKL019W 951 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 ALK2YBL009W 2031 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 HSC82YMR186W 2118 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 YBR184WYBR184W 1572 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 RPO21YDL140C 5202 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 URA2YJL130C 6645 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 FAS1YKL182W 6156 nt3.21□□□□□ -1.89
TY1A-NL1Q12391 SMC3YJL074C 3693 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 PRP22YER013W 3438 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 GUP1YGL084C 1683 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 STU1YBL034C 4542 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 EXO84YBR102C 2262 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 PRE4YFR050C 801 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 JEN1YKL217W 1851 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 CFT2YLR115W 2580 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 EMC1YCL045C 2283 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 DUF1YOL087C 3351 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 YMR31YFR049W 372 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 IPT1YDR072C 1584 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 TAF6YGL112C 1551 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 SPT16YGL207W 3108 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 FAP7YDL166C 594 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 YHL005CYHL005C 393 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 MDN1YLR106C 14733 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 PMP1YCR024C-A 123 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 GIS2YNL255C 462 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 PAN3YKL025C 2040 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 CHS3YBR023C 3498 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 SLA1YBL007C 3735 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 VBA4YDR119W 2307 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 PKH1YDR490C 2301 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 NOP53YPL146C 1368 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 snR72snR72 98 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1A-NL1Q12391 TMA19YKL056C 504 nt3.17□□□□□ -1.9
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