Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 YOL150CYOL150C 312 nt1.75□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 LAA1YJL207C 6045 nt1.75□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 CRM1YGR218W 3255 nt1.74□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 TMA20YER007C-A 546 nt1.74□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 YGL042CYGL042C 306 nt1.74□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt1.74□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 UTP21YLR409C 2820 nt1.74□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 SEC63YOR254C 1992 nt1.73□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 DAD1YDR016C 285 nt1.73□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt1.73□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 YGL165CYGL165C 579 nt1.73□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 YNR025CYNR025C 360 nt1.73□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 KAR9YPL269W 1935 nt1.73□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 PRS3YHL011C 963 nt1.72□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 YIL102CYIL102C 306 nt1.72□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 YJL086CYJL086C 369 nt1.72□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 BUD19YJL188C 309 nt1.72□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 PRP21YJL203W 843 nt1.72□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 ECM9YKR004C 1134 nt1.72□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 VPS63YLR261C 327 nt1.72□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 YNL179CYNL179C 438 nt1.72□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 YPR153WYPR153W 423 nt1.72□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 MGR1YCL044C 1254 nt1.72□□□□□ -2.13
TY3A-GQ12173 NAN1YPL126W 2691 nt1.71□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 TSA2YDR453C 591 nt1.71□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 HOP2YGL033W 657 nt1.71□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 RTT102YGR275W 474 nt1.71□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 TAP42YMR028W 1101 nt1.71□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 RPB5YBR154C 648 nt1.71□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 BPH1YCR032W 6504 nt1.71□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 CLU1YMR012W 3834 nt1.7□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YDL009CYDL009C 324 nt1.7□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YDL016CYDL016C 303 nt1.7□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt1.7□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 VPS74YDR372C 1038 nt1.7□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 PFD1YJL179W 330 nt1.7□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 CSE4YKL049C 690 nt1.7□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt1.7□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 SWS2YNL081C 432 nt1.7□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YNL303WYNL303W 348 nt1.7□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 IML1YJR138W 4755 nt1.7□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 SKI3YPR189W 4299 nt1.69□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 CRD1YDL142C 852 nt1.69□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 snR9snR9 187 nt1.69□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 IRC2YDR112W 309 nt1.69□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 HYR1YIR037W 492 nt1.69□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YML003WYML003W 873 nt1.69□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 ERG29YMR134W 714 nt1.69□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YOR019WYOR019W 2193 nt1.69□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 PIK1YNL267W 3201 nt1.68□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 APL2YKL135C 2181 nt1.68□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YDL062WYDL062W 426 nt1.68□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YDR029WYDR029W 315 nt1.68□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 SCEIQ0160 708 nt1.68□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 NOP10YHR072W-A 177 nt1.68□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 IST3YIR005W 447 nt1.68□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YJR023CYJR023C 402 nt1.68□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YLR458WYLR458W 381 nt1.68□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 LSM2YBL026W 288 nt1.68□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YNL150WYNL150W 408 nt1.68□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YOL029CYOL029C 606 nt1.68□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YPL034WYPL034W 498 nt1.68□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 snR189snR189 189 nt1.68□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YDL187CYDL187C 330 nt1.67□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YHR054CYHR054C 1065 nt1.67□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YIL082WYIL082W 873 nt1.67□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 ATP18YML081C-A 180 nt1.67□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 OST2YOR103C 393 nt1.67□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 CSM4YPL200W 471 nt1.67□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 TRS20YBR254C 528 nt1.67□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 PAC1YOR269W 1485 nt1.67□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt1.66□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 OCA6YDR067C 675 nt1.66□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 BTT1YDR252W 450 nt1.66□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt1.66□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt1.66□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YGR228WYGR228W 345 nt1.66□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 BET4YJL031C 984 nt1.66□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YLR271WYLR271W 825 nt1.66□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 RCN2YOR220W 798 nt1.66□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 GNT1YOR320C 1476 nt1.66□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 NDD1YOR372C 1665 nt1.66□□□□□ -2.14
TY3A-GQ12173 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.65□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 HHT2YNL031C 411 nt1.65□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 CYB5YNL111C 363 nt1.65□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 YPR172WYPR172W 603 nt1.65□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt1.65□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt1.65□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt1.65□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 YCL020WYCL020W 1317 nt1.65□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.64□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 ATP17YDR377W 306 nt1.64□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 YIR020CYIR020C 303 nt1.64□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 NCE101YJL205C 162 nt1.64□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt1.64□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 MRPL44YMR225C 297 nt1.64□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 LSM7YNL147W 348 nt1.64□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 SPO24YPR036W-A 204 nt1.64□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 MSH6YDR097C 3729 nt1.63□□□□□ -2.15
TY3A-GQ12173 NOP53YPL146C 1368 nt1.63□□□□□ -2.15
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