Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 YML037CYML037C 1023 nt3.22□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 YMR324CYMR324C 243 nt3.22□□□□□ -1.89
SSF2Q12153 KAR3YPR141C 2190 nt3.21□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 PHD1YKL043W 1101 nt3.21□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 PCF11YDR228C 1881 nt3.21□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 DLS1YJL065C 504 nt3.2□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 RLI1YDR091C 1827 nt3.2□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 UBP14YBR058C 2346 nt3.2□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 SAK1YER129W 3429 nt3.19□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 ATG13YPR185W 2217 nt3.19□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 YJL202CYJL202C 348 nt3.19□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 YAF9YNL107W 681 nt3.19□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 IRC23YOR044W 474 nt3.19□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 RPN1YHR027C 2982 nt3.19□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 MPH1YIR002C 2982 nt3.19□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 CDC20YGL116W 1833 nt3.19□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 IPT1YDR072C 1584 nt3.18□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 YDR413CYDR413C 576 nt3.18□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 GRX8YLR364W 330 nt3.18□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 LSM7YNL147W 348 nt3.18□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 PGA1YNL158W 597 nt3.18□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 SIN3YOL004W 4611 nt3.18□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 KAP104YBR017C 2757 nt3.17□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 SOK2YMR016C 2358 nt3.17□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 SWT1YOR166C 1377 nt3.17□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 YOR050CYOR050C 348 nt3.17□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 YDR186CYDR186C 2634 nt3.17□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 DNA2YHR164C 4569 nt3.17□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 CAF120YNL278W 3183 nt3.16□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 NHP2YDL208W 471 nt3.16□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 FMP16YDR070C 282 nt3.16□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 YDR102CYDR102C 333 nt3.16□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 LSO2YGR169C-A 279 nt3.16□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 RPL36AYMR194W 303 nt3.16□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 YBL073WYBL073W 312 nt3.16□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 TIM18YOR297C 579 nt3.16□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 FMP23YBR047W 528 nt3.16□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 RGA2YDR379W 3030 nt3.16□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 YPL150WYPL150W 2706 nt3.15□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 TFC4YGR047C 3078 nt3.15□□□□□ -1.9
SSF2Q12153 HRD3YLR207W 2502 nt3.15□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 YDR008CYDR008C 351 nt3.15□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 YGL024WYGL024W 336 nt3.15□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt3.15□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 RPL26AYLR344W 384 nt3.15□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 BCK1YJL095W 4437 nt3.15□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 SGD1YLR336C 2700 nt3.15□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 VPS16YPL045W 2397 nt3.15□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 YGL239CYGL239C 315 nt3.14□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 ISF1YMR081C 1017 nt3.14□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 JSN1YJR091C 3276 nt3.13□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 RRP12YPL012W 3687 nt3.13□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 DYN2YDR424C 279 nt3.13□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 YER097WYER097W 330 nt3.13□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 HSK3YKL138C-A 210 nt3.13□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 RAX2YLR084C 3663 nt3.13□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 KAP123YER110C 3342 nt3.13□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 AIM9YER080W 1884 nt3.13□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 YLR278CYLR278C 4026 nt3.13□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 RSE1YML049C 4086 nt3.13□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 INP53YOR109W 3324 nt3.13□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 YGR067CYGR067C 2415 nt3.12□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 DAD4YDR320C-A 219 nt3.12□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 WIP1YDR374W-A 270 nt3.12□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 RPS24AYER074W 408 nt3.12□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt3.12□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt3.12□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 RTC6YPL183W-A 282 nt3.12□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 YBT1YLL048C 4986 nt3.12□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 TWF1YGR080W 999 nt3.11□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 RPL39YJL189W 156 nt3.11□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt3.1□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 YKL083WYKL083W 615 nt3.1□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 SHE2YKL130C 741 nt3.1□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 YPL229WYPL229W 621 nt3.1□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 YPR203WYPR203W 309 nt3.1□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 GEA1YJR031C 4227 nt3.1□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 DOT6YER088C 2013 nt3.09□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 YBP1YBR216C 2025 nt3.09□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 QCR7YDR529C 384 nt3.09□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 ACB1YGR037C 264 nt3.09□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 TIM13YGR181W 318 nt3.09□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 YIL174WYIL174W 228 nt3.09□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt3.09□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt3.09□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 PSY1YKL076C 384 nt3.09□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt3.09□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 SNC2YOR327C 348 nt3.09□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt3.09□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 snR36snR36 182 nt3.09□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 CYR1YJL005W 6081 nt3.09□□□□□ -1.91
SSF2Q12153 TAE2YPL009C 3117 nt3.09□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 HOS4YIL112W 3252 nt3.09□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 SEC26YDR238C 2922 nt3.09□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 AXL1YPR122W 3627 nt3.08□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 snR65snR65 100 nt3.08□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 SDC1YDR469W 528 nt3.08□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 YFL032WYFL032W 321 nt3.08□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 RPO41YFL036W 4056 nt3.08□□□□□ -1.92
SSF2Q12153 MMS22YLR320W 4365 nt3.08□□□□□ -1.92
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