Protein–RNA interactions for Protein: Q12151

UPC2, Sterol uptake control protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPC2Q12151 TCP1YDR212W 1680 nt3.01□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 HCS1YKL017C 2052 nt3□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 YGL239CYGL239C 315 nt3□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt3□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 RPL36BYPL249C-A 303 nt3□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 SPB1YCL054W 2526 nt2.99□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 RLF2YPR018W 1821 nt2.99□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 YER121WYER121W 345 nt2.99□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 YGR151CYGR151C 336 nt2.99□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 YIL102CYIL102C 306 nt2.99□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.99□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt2.99□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt2.99□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 HEH2YDR458C 1992 nt2.99□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 TFC1YBR123C 1950 nt2.99□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 STT4YLR305C 5703 nt2.99□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 YAK1YJL141C 2424 nt2.99□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.98□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.98□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.98□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.98□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 PAM16YJL104W 450 nt2.98□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 PFD1YJL179W 330 nt2.98□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 IES4YOR189W 351 nt2.98□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 GCD6YDR211W 2139 nt2.98□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 STE23YLR389C 3084 nt2.97□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 PFK26YIL107C 2484 nt2.97□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 VAS1YGR094W 3315 nt2.97□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 PSK2YOL045W 3306 nt2.97□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 CHS2YBR038W 2892 nt2.97□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 YIL032CYIL032C 357 nt2.97□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 RPS28BYLR264W 204 nt2.97□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt2.97□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 YMR324CYMR324C 243 nt2.97□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.97□□□□□ -1.93
UPC2Q12151 FUN30YAL019W 3396 nt2.96□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 DUF1YOL087C 3351 nt2.96□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 YHL042WYHL042W 453 nt2.96□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 RAM2YKL019W 951 nt2.96□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 CHO2YGR157W 2610 nt2.96□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 APC2YLR127C 2562 nt2.95□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 YSP2YDR326C 4317 nt2.95□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 RIM20YOR275C 1986 nt2.95□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 LSO2YGR169C-A 279 nt2.95□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 RPL40AYIL148W 387 nt2.95□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 YBR064WYBR064W 429 nt2.95□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 ROM1YGR070W 3468 nt2.95□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 ITC1YGL133W 3795 nt2.95□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 SOK1YDR006C 2706 nt2.94□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 TIM11YDR322C-A 291 nt2.94□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 DLS1YJL065C 504 nt2.94□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 RPS27AYKL156W 249 nt2.94□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 RPL25YOL127W 429 nt2.94□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.94□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 CSR2YPR030W 3366 nt2.94□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 DRS2YAL026C 4068 nt2.94□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 PSO2YMR137C 1986 nt2.94□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 COG8YML071C 1824 nt2.93□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 POL2YNL262W 6669 nt2.93□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 MDM1YML104C 3384 nt2.93□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 RPA34YJL148W 702 nt2.93□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 YLR012CYLR012C 300 nt2.93□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 YOL057WYOL057W 2136 nt2.93□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 PUF6YDR496C 1971 nt2.92□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 TAF2YCR042C 4224 nt2.92□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 AI2Q0055 2565 nt2.92□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 YER189WYER189W 369 nt2.92□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 YNL010WYNL010W 726 nt2.92□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 SAR1YPL218W 573 nt2.92□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 POM152YMR129W 4014 nt2.91□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 MSB2YGR014W 3921 nt2.91□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 YAT2YER024W 2772 nt2.91□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 ROG1YGL144C 2058 nt2.91□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 snR55snR55 98 nt2.91□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 QCR7YDR529C 384 nt2.91□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 RPN1YHR027C 2982 nt2.91□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 YLR053CYLR053C 327 nt2.91□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 APC9YLR102C 798 nt2.91□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 TRM2YKR056W 1920 nt2.91□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 BCH1YMR237W 2175 nt2.91□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 KAR3YPR141C 2190 nt2.91□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 DSE4YNR067C 3354 nt2.91□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 ASG1YIL130W 2895 nt2.9□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 RCY1YJL204C 2523 nt2.9□□□□□ -1.94
UPC2Q12151 PSK1YAL017W 4071 nt2.9□□□□□ -1.95
UPC2Q12151 RBK1YCR036W 1002 nt2.9□□□□□ -1.95
UPC2Q12151 ATP8Q0080 147 nt2.9□□□□□ -1.95
UPC2Q12151 YHL041WYHL041W 450 nt2.9□□□□□ -1.95
UPC2Q12151 RPL36AYMR194W 303 nt2.9□□□□□ -1.95
UPC2Q12151 CDC20YGL116W 1833 nt2.89□□□□□ -1.95
UPC2Q12151 YME2YMR302C 2553 nt2.89□□□□□ -1.95
UPC2Q12151 YGL024WYGL024W 336 nt2.89□□□□□ -1.95
UPC2Q12151 PHS1YJL097W 654 nt2.89□□□□□ -1.95
UPC2Q12151 PUF4YGL014W 2667 nt2.89□□□□□ -1.95
UPC2Q12151 DIS3YOL021C 3006 nt2.89□□□□□ -1.95
UPC2Q12151 FLO5YHR211W 3228 nt2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.3 ms