Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSRP1Q08945 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms