Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 VPS52YDR484W 1926 nt2.95□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 BRO1YPL084W 2535 nt2.95□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 ESL1YIL151C 3357 nt2.95□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 MDM1YML104C 3384 nt2.95□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 DAD4YDR320C-A 219 nt2.95□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 TIM11YDR322C-A 291 nt2.95□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 AST2YER101C 1293 nt2.95□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 YLR458WYLR458W 381 nt2.95□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 YPK1YKL126W 2043 nt2.95□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 GUP1YGL084C 1683 nt2.95□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 YLR278CYLR278C 4026 nt2.94□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 YJL181WYJL181W 1836 nt2.94□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 YDL011CYDL011C 324 nt2.94□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 YDL041WYDL041W 354 nt2.94□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 YGL149WYGL149W 306 nt2.94□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 TMA22YJR014W 597 nt2.94□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 SMA2YML066C 1110 nt2.94□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt2.94□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 snR43snR43 209 nt2.94□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 TFC4YGR047C 3078 nt2.94□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 PRK1YIL095W 2433 nt2.94□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 SSE1YPL106C 2082 nt2.94□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 NAN1YPL126W 2691 nt2.94□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 RPL35AYDL191W 363 nt2.93□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.93□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 NFT1YKR103W 3657 nt2.93□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 DYN1YKR054C 12279 nt2.93□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 CDC24YAL041W 2565 nt2.93□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 INP52YNL106C 3552 nt2.92□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 TFC1YBR123C 1950 nt2.92□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 LEU3YLR451W 2661 nt2.92□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 Q0092Q0092 141 nt2.92□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 ERP6YGL002W 651 nt2.92□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 YGR069WYGR069W 336 nt2.92□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 PMR1YGL167C 2853 nt2.92□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 JSN1YJR091C 3276 nt2.92□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 CDC36YDL165W 576 nt2.91□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 CSN9YDR179C 489 nt2.91□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt2.91□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 RPL14BYHL001W 417 nt2.91□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.91□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.91□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.91□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.91□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.91□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.91□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 RPL40AYIL148W 387 nt2.91□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 TAR1YLR154W-C 375 nt2.91□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 HCH1YNL281W 462 nt2.91□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 MGR1YCL044C 1254 nt2.91□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 OSW7YFR039C 1533 nt2.91□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 FLO1YAR050W 4614 nt2.91□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 SPB1YCL054W 2526 nt2.9□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 MSS11YMR164C 2277 nt2.9□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 SGO1YOR073W 1773 nt2.9□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 VPS41YDR080W 2979 nt2.9□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 MOT1YPL082C 5604 nt2.9□□□□□ -1.94
SGO1Q08490 NMD2YHR077C 3270 nt2.9□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 RPS24AYER074W 408 nt2.9□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YGL041CYGL041C 204 nt2.9□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YPR203WYPR203W 309 nt2.9□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 PSO2YMR137C 1986 nt2.9□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 RIX1YHR197W 2292 nt2.9□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 SLH1YGR271W 5904 nt2.9□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 MSB2YGR014W 3921 nt2.89□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 SPO14YKR031C 5052 nt2.89□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 ASG1YIL130W 2895 nt2.89□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YCK3YER123W 1575 nt2.89□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 RPS18BYML026C 441 nt2.89□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.89□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 SKT5YBL061C 2091 nt2.89□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 DSE4YNR067C 3354 nt2.89□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 ILS1YBL076C 3219 nt2.88□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YDR344CYDR344C 444 nt2.88□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 MZM1YDR493W 372 nt2.88□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YER189WYER189W 369 nt2.88□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 PNC1YGL037C 651 nt2.88□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YHL005CYHL005C 393 nt2.88□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.88□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YML037CYML037C 1023 nt2.88□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 REV1YOR346W 2958 nt2.88□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 PSK1YAL017W 4071 nt2.88□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 PUF4YGL014W 2667 nt2.87□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 SAK1YER129W 3429 nt2.87□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 CDC20YGL116W 1833 nt2.87□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 MET5YJR137C 4329 nt2.87□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 snR79snR79 84 nt2.87□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.87□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 PAC1YOR269W 1485 nt2.87□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 FRE2YKL220C 2136 nt2.87□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 IKI3YLR384C 4050 nt2.86□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 TRM2YKR056W 1920 nt2.86□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YDR186CYDR186C 2634 nt2.86□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YDL062WYDL062W 426 nt2.86□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YDL211CYDL211C 1119 nt2.86□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 ALG13YGL047W 609 nt2.86□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt2.86□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 RAM2YKL019W 951 nt2.86□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 TRM7YBR061C 933 nt2.86□□□□□ -1.95
SGO1Q08490 YPL216WYPL216W 3309 nt2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 58.2 ms