Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GOLGA3Q08378 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GOLGA3Q08378 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GOLGA3Q08378 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms