Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SRSF4Q08170 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SRSF4Q08170 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms