Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLEQ07864 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLEQ07864 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLEQ07864 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLEQ07864 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLEQ07864 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLEQ07864 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLEQ07864 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POLEQ07864 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLEQ07864 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLEQ07864 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLEQ07864 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLEQ07864 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLEQ07864 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLEQ07864 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLEQ07864 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLEQ07864 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLEQ07864 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
POLEQ07864 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLEQ07864 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLEQ07864 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLEQ07864 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLEQ07864 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLEQ07864 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLEQ07864 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLEQ07864 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLEQ07864 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLEQ07864 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLEQ07864 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLEQ07864 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLEQ07864 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
POLEQ07864 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms