Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SCN1BQ07699 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms