Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHRNB3Q05901 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms