Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPCQ03188 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CENPCQ03188 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms