Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPARDQ03181 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPARDQ03181 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PPARDQ03181 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PPARDQ03181 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPARDQ03181 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PPARDQ03181 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPARDQ03181 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPARDQ03181 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPARDQ03181 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPARDQ03181 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPARDQ03181 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPARDQ03181 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARDQ03181 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARDQ03181 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARDQ03181 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PPARDQ03181 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARDQ03181 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARDQ03181 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARDQ03181 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARDQ03181 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARDQ03181 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARDQ03181 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARDQ03181 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARDQ03181 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARDQ03181 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARDQ03181 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARDQ03181 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARDQ03181 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARDQ03181 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPARDQ03181 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPARDQ03181 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARDQ03181 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPARDQ03181 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPARDQ03181 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARDQ03181 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPARDQ03181 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARDQ03181 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARDQ03181 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PPARDQ03181 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARDQ03181 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPARDQ03181 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPARDQ03181 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPARDQ03181 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PPARDQ03181 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PPARDQ03181 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPARDQ03181 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PPARDQ03181 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PPARDQ03181 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms