Protein–RNA interactions for Protein: Q03088

SVL3, Styryl dye vacuolar localization protein 3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SVL3Q03088 YDR250CYDR250C 276 nt2.36□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 RPL37BYDR500C 267 nt2.36□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.36□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 NCE101YJL205C 162 nt2.36□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 SEC22YLR268W 645 nt2.36□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 CTK3YML112W 891 nt2.36□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 RPS12YOR369C 432 nt2.36□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 RTC6YPL183W-A 282 nt2.36□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.36□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 MGM1YOR211C 2646 nt2.36□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 SCH9YHR205W 2475 nt2.35□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 SSD1YDR293C 3753 nt2.35□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 YDL032WYDL032W 312 nt2.35□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.35□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 YLR053CYLR053C 327 nt2.35□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 YAR068WYAR068W 486 nt2.35□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 MRPL44YMR225C 297 nt2.35□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 YNL122CYNL122C 348 nt2.35□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 YPL276WYPL276W 438 nt2.35□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 IRC16YPR038W 360 nt2.35□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 VPS52YDR484W 1926 nt2.34□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 YGR290WYGR290W 444 nt2.34□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 RPI1YIL119C 1224 nt2.34□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 YKR051WYKR051W 1257 nt2.34□□□□□ -2.03
SVL3Q03088 HCS1YKL017C 2052 nt2.33□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 MYO4YAL029C 4416 nt2.33□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 snR79snR79 84 nt2.33□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 ATP17YDR377W 306 nt2.33□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 LSO2YGR169C-A 279 nt2.33□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.33□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 YJR079WYJR079W 330 nt2.33□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 COX7YMR256C 183 nt2.33□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 PDR11YIL013C 4236 nt2.33□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 UBP1YDL122W 2430 nt2.33□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 STE11YLR362W 2154 nt2.33□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 SGS1YMR190C 4344 nt2.33□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.33□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 NEW1YPL226W 3591 nt2.32□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 SET2YJL168C 2202 nt2.32□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 YCR064CYCR064C 411 nt2.32□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 YDL041WYDL041W 354 nt2.32□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 YDL062WYDL062W 426 nt2.32□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 HOP2YGL033W 657 nt2.32□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 SLM1YIL105C 2061 nt2.32□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 SIR4YDR227W 4077 nt2.32□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 VPS35YJL154C 2835 nt2.32□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.31□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 YGL069CYGL069C 465 nt2.31□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.31□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 MBB1YJL199C 327 nt2.31□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 TSC3YBR058C-A 243 nt2.31□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 ZRG8YER033C 3231 nt2.31□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 NOT5YPR072W 1683 nt2.31□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 STH1YIL126W 4080 nt2.3□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 PDR3YBL005W 2931 nt2.3□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.3□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 PAU3YCR104W 375 nt2.3□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 COA4YLR218C 453 nt2.3□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 DDR48YMR173W 1293 nt2.3□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 YOR248WYOR248W 303 nt2.3□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 YPL068CYPL068C 882 nt2.3□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 DAD3YBR233W-A 285 nt2.3□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 TFC8YPL007C 1767 nt2.3□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 RGA1YOR127W 3024 nt2.3□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 MSB1YOR188W 3414 nt2.29□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 IRE1YHR079C 3348 nt2.29□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 JIP5YPR169W 1479 nt2.29□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 YMR324CYMR324C 243 nt2.29□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 RNH70YGR276C 1662 nt2.28□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 YGL024WYGL024W 336 nt2.28□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 TMA7YLR262C-A 195 nt2.28□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 PDR8YLR266C 2106 nt2.28□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 CYB5YNL111C 363 nt2.28□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 PGA1YNL158W 597 nt2.28□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 YPR039WYPR039W 336 nt2.28□□□□□ -2.04
SVL3Q03088 SPO22YIL073C 2928 nt2.28□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 VMR1YHL035C 4779 nt2.27□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 YBR184WYBR184W 1572 nt2.27□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 KOG1YHR186C 4674 nt2.27□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 YLR149CYLR149C 2193 nt2.27□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 ATG9YDL149W 2994 nt2.27□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 IRA2YOL081W 9240 nt2.27□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.27□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.27□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.27□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.27□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.27□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.27□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.27□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.27□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 RPA34YJL148W 702 nt2.27□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 RPS18BYML026C 441 nt2.27□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 YML108WYML108W 318 nt2.27□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 PEP3YLR148W 2757 nt2.27□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.26□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 ECL1YGR146C 636 nt2.26□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.26□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 SPC29YPL124W 762 nt2.26□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.26□□□□□ -2.05
SVL3Q03088 SKP2YNL311C 2292 nt2.26□□□□□ -2.05
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