Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRF9Q00978 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF9Q00978 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms