Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG7P83436 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG7P83436 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG7P83436 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG7P83436 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG7P83436 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG7P83436 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG7P83436 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG7P83436 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG7P83436 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG7P83436 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG7P83436 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG7P83436 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG7P83436 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COG7P83436 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG7P83436 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG7P83436 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG7P83436 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG7P83436 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG7P83436 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG7P83436 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COG7P83436 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG7P83436 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG7P83436 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG7P83436 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG7P83436 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG7P83436 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
COG7P83436 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COG7P83436 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
COG7P83436 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COG7P83436 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COG7P83436 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG7P83436 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG7P83436 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COG7P83436 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COG7P83436 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
COG7P83436 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COG7P83436 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG7P83436 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
COG7P83436 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COG7P83436 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
COG7P83436 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG7P83436 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG7P83436 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG7P83436 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
COG7P83436 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG7P83436 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG7P83436 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG7P83436 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COG7P83436 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COG7P83436 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG7P83436 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COG7P83436 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COG7P83436 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COG7P83436 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG7P83436 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG7P83436 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms