Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNA1P78396 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms