Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HBG1P69891 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HBG1P69891 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HBG1P69891 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HBG1P69891 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HBG1P69891 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HBG1P69891 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HBG1P69891 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms