Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ERVK-24P63145 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVK-24P63145 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms