Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
HERVK_113P61574 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms