Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP1P56182 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP1P56182 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP1P56182 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRP1P56182 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP1P56182 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP1P56182 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP1P56182 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP1P56182 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP1P56182 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP1P56182 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP1P56182 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP1P56182 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP1P56182 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP1P56182 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP1P56182 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP1P56182 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP1P56182 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP1P56182 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP1P56182 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP1P56182 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP1P56182 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP1P56182 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP1P56182 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP1P56182 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP1P56182 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP1P56182 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP1P56182 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP1P56182 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP1P56182 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP1P56182 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP1P56182 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP1P56182 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP1P56182 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP1P56182 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP1P56182 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP1P56182 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP1P56182 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP1P56182 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP1P56182 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP1P56182 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP1P56182 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP1P56182 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP1P56182 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP1P56182 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP1P56182 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP1P56182 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP1P56182 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP1P56182 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP1P56182 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP1P56182 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP1P56182 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP1P56182 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP1P56182 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP1P56182 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP1P56182 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP1P56182 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP1P56182 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP1P56182 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP1P56182 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP1P56182 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP1P56182 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP1P56182 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP1P56182 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP1P56182 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP1P56182 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP1P56182 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP1P56182 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP1P56182 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP1P56182 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP1P56182 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP1P56182 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP1P56182 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP1P56182 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP1P56182 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP1P56182 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP1P56182 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP1P56182 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP1P56182 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP1P56182 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP1P56182 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP1P56182 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP1P56182 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP1P56182 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP1P56182 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP1P56182 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP1P56182 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP1P56182 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP1P56182 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP1P56182 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP1P56182 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP1P56182 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP1P56182 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP1P56182 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP1P56182 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP1P56182 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP1P56182 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP1P56182 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP1P56182 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRP1P56182 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms