Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ELLP55199 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ELLP55199 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ELLP55199 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ELLP55199 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ELLP55199 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms