Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHB4P54760 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHB4P54760 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms