Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRAP54198 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRAP54198 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRAP54198 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRAP54198 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRAP54198 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRAP54198 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRAP54198 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRAP54198 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIRAP54198 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRAP54198 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRAP54198 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRAP54198 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRAP54198 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRAP54198 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRAP54198 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRAP54198 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRAP54198 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRAP54198 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRAP54198 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRAP54198 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRAP54198 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRAP54198 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRAP54198 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIRAP54198 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HIRAP54198 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRAP54198 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRAP54198 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRAP54198 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRAP54198 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRAP54198 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRAP54198 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRAP54198 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRAP54198 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRAP54198 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRAP54198 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRAP54198 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRAP54198 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIRAP54198 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIRAP54198 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRAP54198 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRAP54198 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRAP54198 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRAP54198 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRAP54198 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRAP54198 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRAP54198 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRAP54198 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRAP54198 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRAP54198 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRAP54198 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRAP54198 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIRAP54198 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRAP54198 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRAP54198 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRAP54198 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRAP54198 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRAP54198 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRAP54198 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRAP54198 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRAP54198 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIRAP54198 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRAP54198 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRAP54198 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRAP54198 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRAP54198 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRAP54198 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRAP54198 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRAP54198 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRAP54198 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRAP54198 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRAP54198 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRAP54198 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRAP54198 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRAP54198 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRAP54198 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRAP54198 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRAP54198 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms