Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GBX2P52951 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBX2P52951 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBX2P52951 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBX2P52951 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBX2P52951 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBX2P52951 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBX2P52951 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBX2P52951 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBX2P52951 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GBX2P52951 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX2P52951 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX2P52951 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX2P52951 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX2P52951 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX2P52951 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX2P52951 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX2P52951 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX2P52951 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX2P52951 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX2P52951 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX2P52951 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX2P52951 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX2P52951 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX2P52951 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX2P52951 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GBX2P52951 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX2P52951 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX2P52951 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX2P52951 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX2P52951 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX2P52951 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX2P52951 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX2P52951 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GBX2P52951 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GBX2P52951 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GBX2P52951 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms