Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDST1P52848 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDST1P52848 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDST1P52848 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDST1P52848 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDST1P52848 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDST1P52848 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NDST1P52848 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDST1P52848 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDST1P52848 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDST1P52848 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDST1P52848 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDST1P52848 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDST1P52848 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDST1P52848 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDST1P52848 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDST1P52848 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDST1P52848 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDST1P52848 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDST1P52848 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDST1P52848 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDST1P52848 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDST1P52848 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDST1P52848 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDST1P52848 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDST1P52848 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDST1P52848 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDST1P52848 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDST1P52848 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDST1P52848 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDST1P52848 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDST1P52848 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDST1P52848 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDST1P52848 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDST1P52848 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NDST1P52848 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDST1P52848 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDST1P52848 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDST1P52848 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDST1P52848 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDST1P52848 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDST1P52848 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDST1P52848 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDST1P52848 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDST1P52848 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDST1P52848 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDST1P52848 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDST1P52848 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDST1P52848 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDST1P52848 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NDST1P52848 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NDST1P52848 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDST1P52848 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDST1P52848 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDST1P52848 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDST1P52848 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDST1P52848 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDST1P52848 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDST1P52848 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDST1P52848 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDST1P52848 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDST1P52848 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDST1P52848 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDST1P52848 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDST1P52848 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NDST1P52848 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NDST1P52848 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NDST1P52848 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDST1P52848 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDST1P52848 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDST1P52848 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDST1P52848 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDST1P52848 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NDST1P52848 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDST1P52848 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDST1P52848 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDST1P52848 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDST1P52848 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDST1P52848 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NDST1P52848 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDST1P52848 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDST1P52848 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDST1P52848 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDST1P52848 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDST1P52848 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDST1P52848 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDST1P52848 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDST1P52848 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDST1P52848 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDST1P52848 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDST1P52848 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDST1P52848 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDST1P52848 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDST1P52848 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDST1P52848 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NDST1P52848 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NDST1P52848 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDST1P52848 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDST1P52848 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NDST1P52848 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms