Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms