Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT8P50990 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT8P50990 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT8P50990 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT8P50990 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT8P50990 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT8P50990 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT8P50990 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT8P50990 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCT8P50990 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCT8P50990 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCT8P50990 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT8P50990 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT8P50990 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT8P50990 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT8P50990 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT8P50990 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT8P50990 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCT8P50990 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCT8P50990 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCT8P50990 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCT8P50990 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCT8P50990 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCT8P50990 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCT8P50990 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCT8P50990 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCT8P50990 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCT8P50990 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCT8P50990 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCT8P50990 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCT8P50990 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCT8P50990 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCT8P50990 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCT8P50990 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCT8P50990 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCT8P50990 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCT8P50990 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCT8P50990 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCT8P50990 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCT8P50990 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCT8P50990 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCT8P50990 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCT8P50990 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCT8P50990 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCT8P50990 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCT8P50990 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCT8P50990 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCT8P50990 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCT8P50990 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCT8P50990 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCT8P50990 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCT8P50990 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCT8P50990 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCT8P50990 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCT8P50990 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCT8P50990 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCT8P50990 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCT8P50990 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCT8P50990 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCT8P50990 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCT8P50990 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCT8P50990 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCT8P50990 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCT8P50990 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCT8P50990 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCT8P50990 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCT8P50990 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCT8P50990 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCT8P50990 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCT8P50990 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCT8P50990 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCT8P50990 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCT8P50990 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCT8P50990 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCT8P50990 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCT8P50990 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms