Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLCP48506 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLCP48506 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLCP48506 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLCP48506 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLCP48506 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLCP48506 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLCP48506 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLCP48506 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLCP48506 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLCP48506 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLCP48506 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLCP48506 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLCP48506 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLCP48506 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLCP48506 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLCP48506 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLCP48506 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLCP48506 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLCP48506 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLCP48506 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLCP48506 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLCP48506 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLCP48506 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLCP48506 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCLCP48506 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLCP48506 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLCP48506 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLCP48506 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLCP48506 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLCP48506 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLCP48506 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLCP48506 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLCP48506 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLCP48506 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLCP48506 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLCP48506 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLCP48506 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLCP48506 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLCP48506 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCLCP48506 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLCP48506 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLCP48506 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLCP48506 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLCP48506 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLCP48506 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLCP48506 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLCP48506 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLCP48506 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLCP48506 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLCP48506 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLCP48506 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLCP48506 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLCP48506 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLCP48506 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLCP48506 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLCP48506 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLCP48506 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GCLCP48506 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLCP48506 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLCP48506 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLCP48506 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLCP48506 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLCP48506 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLCP48506 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLCP48506 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLCP48506 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLCP48506 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLCP48506 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCLCP48506 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCLCP48506 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCLCP48506 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCLCP48506 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLCP48506 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLCP48506 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLCP48506 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLCP48506 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLCP48506 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLCP48506 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLCP48506 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLCP48506 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLCP48506 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLCP48506 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLCP48506 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLCP48506 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLCP48506 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLCP48506 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCLCP48506 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLCP48506 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLCP48506 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLCP48506 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLCP48506 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLCP48506 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLCP48506 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLCP48506 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLCP48506 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLCP48506 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLCP48506 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLCP48506 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCLCP48506 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms