Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIA4P48058 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIA4P48058 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms