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Protein–RNA interactions for Protein: P47050
RTT101, Cullin-8, yeast
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842 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
RTT101
P47050
YER188C-A
YER188C-A
300 nt
2.36
□□□□□ -2.03
RTT101
P47050
VOA1
YGR106C
798 nt
2.36
□□□□□ -2.03
RTT101
P47050
RPS24B
YIL069C
408 nt
2.36
□□□□□ -2.03
RTT101
P47050
RPS29A
YLR388W
171 nt
2.36
□□□□□ -2.03
RTT101
P47050
AIM32
YML050W
936 nt
2.36
□□□□□ -2.03
RTT101
P47050
SPF1
YEL031W
3648 nt
2.36
□□□□□ -2.03
RTT101
P47050
PHO2
YDL106C
1680 nt
2.35
□□□□□ -2.03
RTT101
P47050
YER137W-A
YER137W-A
306 nt
2.35
□□□□□ -2.03
RTT101
P47050
RPS20
YHL015W
366 nt
2.35
□□□□□ -2.03
RTT101
P47050
ESF2
YNR054C
951 nt
2.35
□□□□□ -2.03
RTT101
P47050
ATP15
YPL271W
189 nt
2.35
□□□□□ -2.03
RTT101
P47050
SPB1
YCL054W
2526 nt
2.35
□□□□□ -2.03
RTT101
P47050
SAP190
YKR028W
3102 nt
2.35
□□□□□ -2.03
RTT101
P47050
LEU3
YLR451W
2661 nt
2.35
□□□□□ -2.03
RTT101
P47050
ATP17
YDR377W
306 nt
2.34
□□□□□ -2.03
RTT101
P47050
SNX41
YDR425W
1878 nt
2.34
□□□□□ -2.03
RTT101
P47050
SWR1
YDR334W
4545 nt
2.34
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
DNL4
YOR005C
2835 nt
2.34
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
SSY1
YDR160W
2559 nt
2.34
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
APC2
YLR127C
2562 nt
2.34
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
MSL5
YLR116W
1431 nt
2.34
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
IRA2
YOL081W
9240 nt
2.33
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
MKT1
YNL085W
2493 nt
2.33
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
YIL166C
YIL166C
1629 nt
2.33
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
GPI8
YDR331W
1236 nt
2.33
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
YIL058W
YIL058W
285 nt
2.33
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
RPS1A
YLR441C
768 nt
2.33
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
MRPL50
YNR022C
420 nt
2.33
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
ATP3
YBR039W
936 nt
2.33
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
CSF1
YLR087C
8877 nt
2.33
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
RLF2
YPR018W
1821 nt
2.33
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
SPC72
YAL047C
1869 nt
2.33
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
YEF3
YLR249W
3135 nt
2.33
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
YNL277W-A
YNL277W-A
189 nt
2.32
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
EGD1
YPL037C
474 nt
2.32
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
PSD2
YGR170W
3417 nt
2.32
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
SEC16
YPL085W
6588 nt
2.31
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
ADK1
YDR226W
669 nt
2.31
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
tT(UGU)Q1
tT(UGU)Q1
76 nt
2.31
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
HYR1
YIR037W
492 nt
2.31
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
ICY1
YMR195W
384 nt
2.31
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
INP53
YOR109W
3324 nt
2.3
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
COX7
YMR256C
183 nt
2.3
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
RPL25
YOL127W
429 nt
2.3
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
YOL159C-A
YOL159C-A
273 nt
2.3
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
YOR121C
YOR121C
306 nt
2.3
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
POM152
YMR129W
4014 nt
2.3
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
GNT1
YOR320C
1476 nt
2.3
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
DIE2
YGR227W
1578 nt
2.3
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
SSE1
YPL106C
2082 nt
2.3
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
PUF4
YGL014W
2667 nt
2.29
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
YSW1
YBR148W
1830 nt
2.29
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
PEX4
YGR133W
552 nt
2.29
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
NCE101
YJL205C
162 nt
2.29
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
RPS22B
YLR367W
393 nt
2.29
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
YML009C-A
YML009C-A
327 nt
2.29
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
YNL146W
YNL146W
303 nt
2.29
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
COQ10
YOL008W
624 nt
2.29
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
PUT3
YKL015W
2940 nt
2.29
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
INO80
YGL150C
4470 nt
2.29
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
YPK1
YKL126W
2043 nt
2.29
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
YJR098C
YJR098C
1971 nt
2.29
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
PSK2
YOL045W
3306 nt
2.28
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
DNF1
YER166W
4716 nt
2.28
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
YER076W-A
YER076W-A
348 nt
2.28
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
YGR035C
YGR035C
351 nt
2.28
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
YHR052W-A
YHR052W-A
195 nt
2.28
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
YHR054W-A
YHR054W-A
195 nt
2.28
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
NUP82
YJL061W
2142 nt
2.28
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
FPR1
YNL135C
345 nt
2.28
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
YOR105W
YOR105W
327 nt
2.28
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
YOR146W
YOR146W
306 nt
2.28
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
TRM7
YBR061C
933 nt
2.28
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
NPR3
YHL023C
3441 nt
2.28
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
BRO1
YPL084W
2535 nt
2.28
□□□□□ -2.04
RTT101
P47050
MRP10
YDL045W-A
288 nt
2.27
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
YDL068W
YDL068W
330 nt
2.27
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
YDL240C-A
YDL240C-A
138 nt
2.27
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
RTT102
YGR275W
474 nt
2.27
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
TPS2
YDR074W
2691 nt
2.27
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
YJL016W
YJL016W
1686 nt
2.27
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
SSD1
YDR293C
3753 nt
2.27
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
PSO2
YMR137C
1986 nt
2.27
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
VPS52
YDR484W
1926 nt
2.27
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
ECM25
YJL201W
1800 nt
2.26
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
YOL098C
YOL098C
3114 nt
2.26
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
RPS24A
YER074W
408 nt
2.26
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
URM1
YIL008W
300 nt
2.26
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
ATP7
YKL016C
525 nt
2.26
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
RPL40B
YKR094C
387 nt
2.26
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
YLR031W
YLR031W
561 nt
2.26
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
CCW14
YLR390W-A
717 nt
2.26
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
CGI121
YML036W
546 nt
2.26
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
YPL225W
YPL225W
441 nt
2.26
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
YPR016W-A
YPR016W-A
261 nt
2.26
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
COX1
Q0045
1605 nt
2.26
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
YJL181W
YJL181W
1836 nt
2.26
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
UTP22
YGR090W
3714 nt
2.26
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
AMS1
YGL156W
3252 nt
2.25
□□□□□ -2.05
RTT101
P47050
YRB1
YDR002W
606 nt
2.25
□□□□□ -2.05
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