Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACADSBP45954 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms