Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPHP41219 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPHP41219 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPHP41219 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPHP41219 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPHP41219 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPHP41219 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPHP41219 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPHP41219 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPHP41219 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPHP41219 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPHP41219 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPHP41219 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPHP41219 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPHP41219 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPHP41219 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPHP41219 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPHP41219 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPHP41219 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPHP41219 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPHP41219 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPHP41219 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPHP41219 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPHP41219 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPHP41219 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPHP41219 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPHP41219 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPHP41219 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPHP41219 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPHP41219 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPHP41219 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPHP41219 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPHP41219 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPHP41219 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPHP41219 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPHP41219 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPHP41219 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPHP41219 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPHP41219 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPHP41219 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPHP41219 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPHP41219 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPHP41219 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPHP41219 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPHP41219 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPHP41219 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPHP41219 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPHP41219 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPHP41219 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPHP41219 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPHP41219 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPHP41219 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRPHP41219 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPHP41219 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPHP41219 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPHP41219 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPHP41219 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPHP41219 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPHP41219 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPHP41219 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPHP41219 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPHP41219 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPHP41219 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPHP41219 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPHP41219 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPHP41219 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPHP41219 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPHP41219 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPHP41219 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPHP41219 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPHP41219 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPHP41219 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPHP41219 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPHP41219 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPHP41219 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPHP41219 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPHP41219 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPHP41219 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPHP41219 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPHP41219 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPHP41219 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPHP41219 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPHP41219 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPHP41219 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPHP41219 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPHP41219 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPHP41219 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPHP41219 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPHP41219 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPHP41219 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPHP41219 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPHP41219 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPHP41219 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPHP41219 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPHP41219 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPHP41219 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPHP41219 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPHP41219 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPHP41219 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPHP41219 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms