Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH1P40692 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH1P40692 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH1P40692 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH1P40692 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH1P40692 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH1P40692 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH1P40692 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH1P40692 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH1P40692 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH1P40692 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH1P40692 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH1P40692 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH1P40692 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH1P40692 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH1P40692 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MLH1P40692 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH1P40692 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH1P40692 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH1P40692 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH1P40692 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH1P40692 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH1P40692 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH1P40692 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH1P40692 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH1P40692 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH1P40692 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH1P40692 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH1P40692 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH1P40692 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH1P40692 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH1P40692 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MLH1P40692 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH1P40692 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH1P40692 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH1P40692 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH1P40692 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH1P40692 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH1P40692 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH1P40692 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH1P40692 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH1P40692 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH1P40692 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH1P40692 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH1P40692 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH1P40692 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH1P40692 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH1P40692 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH1P40692 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH1P40692 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MLH1P40692 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH1P40692 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH1P40692 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH1P40692 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH1P40692 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH1P40692 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH1P40692 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH1P40692 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH1P40692 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH1P40692 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH1P40692 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH1P40692 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH1P40692 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH1P40692 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MLH1P40692 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MLH1P40692 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH1P40692 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MLH1P40692 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MLH1P40692 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MLH1P40692 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MLH1P40692 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MLH1P40692 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MLH1P40692 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MLH1P40692 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MLH1P40692 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MLH1P40692 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MLH1P40692 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MLH1P40692 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MLH1P40692 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MLH1P40692 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms