Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 CSI2YOL007C 1026 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 YPR063CYPR063C 423 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 ESA1YOR244W 1338 nt0.64□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 COX1Q0045 1605 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 YHR022CYHR022C 771 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 NSL1YPL233W 651 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 SGD1YLR336C 2700 nt0.63□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 YGL118CYGL118C 438 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 FYV4YHR059W 393 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 SAS3YBL052C 2496 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 MUK1YPL070W 1839 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 snR68snR68 136 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 snR14snR14 160 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 YBR032WYBR032W 303 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 snR35snR35 204 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 ASM4YDL088C 1587 nt0.62□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 CDC50YCR094W 1176 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 NSE4YDL105W 1209 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 IES5YER092W 378 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 YFR056CYFR056C 369 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 YAP3YHL009C 993 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 CUR1YPR158W 759 nt0.61□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 ASI3YNL008C 2031 nt0.6□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 SRB4YER022W 2064 nt0.6□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 SPC1YJR010C-A 285 nt0.6□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 YSW1YBR148W 1830 nt0.6□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 YCR015CYCR015C 954 nt0.59□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 TCA17YEL048C 459 nt0.59□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 YGL039WYGL039W 1047 nt0.59□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 YIL012WYIL012W 342 nt0.59□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 VPS55YJR044C 423 nt0.59□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 YMR147WYMR147W 672 nt0.59□□□□□ -2.31
YRF1-2P40105 YJL022WYJL022W 309 nt0.59□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 YNR068CYNR068C 819 nt0.59□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 YBR063CYBR063C 1215 nt0.59□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 AIM41YOR215C 558 nt0.58□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 YFR054CYFR054C 579 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 RPL40AYIL148W 387 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 MRPL24YMR193W 777 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.57□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 NCA2YPR155C 1851 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 BTN2YGR142W 1233 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 MRPL40YPL173W 894 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 RLM1YPL089C 2031 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 AI3Q0060 1248 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 YGL177WYGL177W 348 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 PRS3YHL011C 963 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 RIF2YLR453C 1188 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 MER1YNL210W 813 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 SNC2YOR327C 348 nt0.56□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 YLL054CYLL054C 2532 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 YDR042CYDR042C 603 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 RPL9AYGL147C 576 nt0.55□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 AZF1YOR113W 2745 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 CMC2YBL059C-A 330 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 YNL010WYNL010W 726 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 PEX15YOL044W 1152 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 HAL9YOL089C 3093 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 DGR2YKL121W 2559 nt0.54□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 MDM36YPR083W 1740 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 YDR286CYDR286C 345 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 NSE3YDR288W 912 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 YER091C-AYER091C-A 222 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 YNL089CYNL089C 477 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 BFR1YOR198C 1413 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 ALK1YGL021W 2283 nt0.53□□□□□ -2.32
YRF1-2P40105 MFA1YDR461W 111 nt0.53□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 SMD1YGR074W 441 nt0.53□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 CYB5YNL111C 363 nt0.53□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 ARL3YPL051W 597 nt0.53□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 ADF1YCL058W-A 342 nt0.53□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 KAR9YPL269W 1935 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 HOP2YGL033W 657 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 RAM2YKL019W 951 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 YAL069WYAL069W 315 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 YPR014CYPR014C 330 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 MVP1YMR004W 1536 nt0.52□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 NUP120YKL057C 3114 nt0.51□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 PSO2YMR137C 1986 nt0.51□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt0.51□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 YNL179CYNL179C 438 nt0.51□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 CDC5YMR001C 2118 nt0.51□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 YGR250CYGR250C 2346 nt0.51□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 YML047W-AYML047W-A 366 nt0.5□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 NOP12YOL041C 1380 nt0.5□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 NNF2YGR089W 2811 nt0.5□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 BPH1YCR032W 6504 nt0.5□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 RPB5YBR154C 648 nt0.49□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 RPL35BYDL136W 363 nt0.49□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 YER088C-AYER088C-A 324 nt0.49□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 CIN2YPL241C 807 nt0.49□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 SST2YLR452C 2097 nt0.49□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 MYO1YHR023W 5787 nt0.48□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 SNA4YDL123W 423 nt0.48□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.8 ms