Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
ITGAEP38570 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms