Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms