Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM5P33992 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM5P33992 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM5P33992 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM5P33992 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM5P33992 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM5P33992 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCM5P33992 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM5P33992 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM5P33992 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM5P33992 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM5P33992 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM5P33992 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM5P33992 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM5P33992 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM5P33992 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM5P33992 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM5P33992 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM5P33992 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM5P33992 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM5P33992 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM5P33992 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM5P33992 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCM5P33992 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCM5P33992 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM5P33992 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM5P33992 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM5P33992 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM5P33992 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM5P33992 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM5P33992 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM5P33992 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM5P33992 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM5P33992 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM5P33992 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM5P33992 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM5P33992 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM5P33992 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCM5P33992 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM5P33992 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM5P33992 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM5P33992 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM5P33992 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM5P33992 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM5P33992 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM5P33992 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM5P33992 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM5P33992 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM5P33992 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM5P33992 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM5P33992 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM5P33992 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM5P33992 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM5P33992 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCM5P33992 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM5P33992 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM5P33992 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM5P33992 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM5P33992 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM5P33992 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM5P33992 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM5P33992 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM5P33992 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM5P33992 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM5P33992 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM5P33992 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM5P33992 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM5P33992 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM5P33992 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM5P33992 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM5P33992 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCM5P33992 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCM5P33992 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCM5P33992 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCM5P33992 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCM5P33992 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms