Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA3P32297 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA3P32297 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms