Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCKARP32238 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKARP32238 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKARP32238 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKARP32238 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKARP32238 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKARP32238 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKARP32238 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKARP32238 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKARP32238 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKARP32238 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKARP32238 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKARP32238 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKARP32238 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKARP32238 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKARP32238 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKARP32238 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKARP32238 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKARP32238 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKARP32238 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKARP32238 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKARP32238 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKARP32238 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCKARP32238 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCKARP32238 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCKARP32238 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCKARP32238 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCKARP32238 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCKARP32238 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCKARP32238 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKARP32238 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKARP32238 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKARP32238 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKARP32238 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKARP32238 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKARP32238 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKARP32238 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKARP32238 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKARP32238 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKARP32238 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms