Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXC12P31275 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXC12P31275 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms