Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM5AP29375 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM5AP29375 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KDM5AP29375 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
KDM5AP29375 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms