Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MCM3P25205 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MCM3P25205 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCM3P25205 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCM3P25205 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCM3P25205 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCM3P25205 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCM3P25205 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCM3P25205 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MCM3P25205 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCM3P25205 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCM3P25205 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCM3P25205 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCM3P25205 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCM3P25205 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCM3P25205 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCM3P25205 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCM3P25205 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCM3P25205 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCM3P25205 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCM3P25205 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MCM3P25205 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MCM3P25205 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCM3P25205 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCM3P25205 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCM3P25205 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCM3P25205 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCM3P25205 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MCM3P25205 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MCM3P25205 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCM3P25205 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCM3P25205 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCM3P25205 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCM3P25205 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCM3P25205 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCM3P25205 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCM3P25205 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MCM3P25205 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCM3P25205 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCM3P25205 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCM3P25205 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCM3P25205 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MCM3P25205 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCM3P25205 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCM3P25205 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCM3P25205 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCM3P25205 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCM3P25205 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCM3P25205 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCM3P25205 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCM3P25205 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCM3P25205 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCM3P25205 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCM3P25205 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCM3P25205 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCM3P25205 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCM3P25205 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCM3P25205 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCM3P25205 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCM3P25205 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCM3P25205 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCM3P25205 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MCM3P25205 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM3P25205 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM3P25205 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM3P25205 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM3P25205 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM3P25205 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM3P25205 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM3P25205 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM3P25205 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM3P25205 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM3P25205 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM3P25205 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MCM3P25205 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms