Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF4BP23588 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF4BP23588 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.3 ms