Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPS6KB1P23443 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPS6KB1P23443 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms