Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX1P22670 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX1P22670 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX1P22670 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX1P22670 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX1P22670 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX1P22670 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX1P22670 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX1P22670 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX1P22670 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX1P22670 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX1P22670 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX1P22670 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX1P22670 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX1P22670 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX1P22670 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX1P22670 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX1P22670 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX1P22670 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX1P22670 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX1P22670 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX1P22670 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX1P22670 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX1P22670 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX1P22670 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX1P22670 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX1P22670 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX1P22670 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX1P22670 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX1P22670 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX1P22670 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX1P22670 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX1P22670 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX1P22670 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX1P22670 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX1P22670 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX1P22670 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX1P22670 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX1P22670 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX1P22670 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX1P22670 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX1P22670 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX1P22670 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX1P22670 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX1P22670 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX1P22670 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX1P22670 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX1P22670 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX1P22670 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX1P22670 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX1P22670 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX1P22670 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX1P22670 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX1P22670 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX1P22670 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX1P22670 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX1P22670 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX1P22670 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX1P22670 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX1P22670 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX1P22670 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX1P22670 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX1P22670 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX1P22670 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX1P22670 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX1P22670 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX1P22670 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX1P22670 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX1P22670 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX1P22670 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX1P22670 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX1P22670 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX1P22670 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX1P22670 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX1P22670 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX1P22670 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX1P22670 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX1P22670 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX1P22670 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX1P22670 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX1P22670 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX1P22670 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX1P22670 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX1P22670 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms