Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP4AP20648 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP4AP20648 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms