Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN2P17655 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN2P17655 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms