Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM27P14373 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM27P14373 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms