Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC5A1P13866 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC5A1P13866 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms